Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01800 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01800 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01800 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01800 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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