Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01797 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01797 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01797 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01797 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01797 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01797 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01797 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01797 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms