Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01672 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01672 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01672 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01672 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01672 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01672 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01672 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01672 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01672 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01672 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01672 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01672 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms