Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01641 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01641 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01641 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01641 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01641 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01641 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01641 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01641 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01641 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01641 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01641 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01641 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms