Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01638 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01638 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01638 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01638 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01638 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01638 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01638 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01638 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01638 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01638 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms