Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4bP01029 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4bP01029 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bP01029 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bP01029 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bP01029 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4bP01029 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4bP01029 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4bP01029 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4bP01029 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bP01029 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bP01029 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bP01029 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bP01029 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bP01029 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bP01029 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bP01029 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms