Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcn2O88968 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms