Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1O88746 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1O88746 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1O88746 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1O88746 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms