Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms