Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad51dO55230 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad51dO55230 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms