Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt5hO55201 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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