Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2a2O55143 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms