Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms