Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole2O54956 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms