Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbrO54799 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbrO54799 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbrO54799 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms