Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EdaO54693 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EdaO54693 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EdaO54693 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EdaO54693 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EdaO54693 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EdaO54693 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EdaO54693 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EdaO54693 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms