Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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