Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms