Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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