Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna6O35345 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kpna6O35345 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms