Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnih2O35089 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih2O35089 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cnih2O35089 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih2O35089 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnih2O35089 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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