Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3cO35066 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3cO35066 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms