Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms