Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms