Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MttpO08601 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MttpO08601 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MttpO08601 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MttpO08601 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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MttpO08601 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MttpO08601 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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MttpO08601 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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MttpO08601 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MttpO08601 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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