Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltaO08585 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltaO08585 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltaO08585 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltaO08585 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltaO08585 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltaO08585 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltaO08585 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltaO08585 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltaO08585 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltaO08585 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltaO08585 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CltaO08585 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltaO08585 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltaO08585 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltaO08585 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltaO08585 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltaO08585 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CltaO08585 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltaO08585 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltaO08585 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltaO08585 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltaO08585 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltaO08585 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltaO08585 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms