Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec22bO08547 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms