Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp955bL7N232 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp955bL7N232 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms