Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3685J3QPP2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms