Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5849J3QPE5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms