Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c2J3QNM1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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