Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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