Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms