Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms