Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c3J3QJW5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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