Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms