Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc4lG5E8X2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms