Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn20G5E8X0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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