Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms