Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms