Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms