Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r39G3UWE6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r39G3UWE6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms