Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34aG3UW52 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.2 ms