Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r76F8VQ63 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r76F8VQ63 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms