Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms