Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres1F6ZIS7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms