Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Igkv1-99F6XWB2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms