Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms