Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms