Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms